הכשרת EMDR פתוחה אך ורק לאנשי מקצוע מוסמכים בתחום בריאות הנפש בעלי תואר שני: פסיכולוגים, פסיכיאטרים, עו"סים, מטפלים באומנויות ממוסדות מוכרים.
 
הקורס כולל שלושה חלקים:
תיאוריה - כולל הרצאה, סרטי וידאו והדגמות.
בשלב 1 ארבעה מפגשים, ארבע שעות בכל פעם. סה"כ 16 שעות.
בשלב 2 שלושה מפגשים, ארבע שעות בכל פעם. סה”כ 12 שעות.
 
פרקטיקום - התנסות מעשית בקבוצות קטנות כאשר כל משתתף ימלא
תפקידי מטפל ומטופל וילווה בהדרכה, בקבוצות של עד 12 משתתפים.
בשלב 1 ארבעה מפגשים, ארבע שעות בכל פעם. סה"כ 16 שעות.
בשלב 2 שלושה מפגשים, ארבע שעות בכל פעם. סה”כ 12 שעות.
 
הדרכה על מקרים מהשטח - מפגשים בקבוצות של עד 12 משתתפים.
בשלב 1, ארבעה מפגשים, שלוש שעות בכל פעם. סה"כ 12 שעות.
בשלב 2, ארבעה מפגשים, שלוש שעות בכל פעם. סה"כ 12 שעות.